Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Otx1P80205 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms