Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb1P70662 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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