Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprvP70289 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprvP70289 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
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PtprvP70289 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprvP70289 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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PtprvP70289 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprvP70289 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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PtprvP70289 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprvP70289 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms