Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab3cP62823 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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