Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ufm1P61961 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms