Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd6P61407 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd6P61407 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd6P61407 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd6P61407 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd6P61407 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd6P61407 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd6P61407 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd6P61407 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd6P61407 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd6P61407 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd6P61407 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tdrd6P61407 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd6P61407 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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