Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2kP61087 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms