Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia3P60469 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia3P60469 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms