Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms