Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gsc2P56916 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms