Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms