Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bace1P56818 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bace1P56818 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bace1P56818 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bace1P56818 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bace1P56818 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bace1P56818 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bace1P56818 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bace1P56818 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms