Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp5P56399 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms