Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PctpP53808 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PctpP53808 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PctpP53808 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms