Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa6P50704 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms