Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TspoP50637 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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TspoP50637 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TspoP50637 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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TspoP50637 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TspoP50637 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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