Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpbP50405 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpbP50405 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SftpbP50405 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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