Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cxcl5P50228 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cxcl5P50228 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cxcl5P50228 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cxcl5P50228 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cxcl5P50228 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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