Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cav1P49817 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cav1P49817 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cav1P49817 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cav1P49817 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cav1P49817 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cav1P49817 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cav1P49817 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cav1P49817 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cav1P49817 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cav1P49817 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cav1P49817 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cav1P49817 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cav1P49817 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cav1P49817 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cav1P49817 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms