Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rfx1P48377 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rfx1P48377 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rfx1P48377 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rfx1P48377 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rfx1P48377 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rfx1P48377 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx1P48377 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rfx1P48377 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rfx1P48377 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rfx1P48377 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx1P48377 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx1P48377 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx1P48377 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx1P48377 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx1P48377 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx1P48377 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rfx1P48377 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rfx1P48377 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rfx1P48377 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rfx1P48377 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rfx1P48377 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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