Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrprbP47758 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrprbP47758 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrprbP47758 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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