Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Tnfsf9P41274 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tnfsf9P41274 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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