Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mmp9P41245 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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