Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk2P38575 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk2P38575 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk2P38575 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk2P38575 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk2P38575 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk2P38575 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk2P38575 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk2P38575 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk2P38575 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk2P38575 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk2P38575 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk2P38575 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk2P38575 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Upk2P38575 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk2P38575 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk2P38575 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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