Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nedd1P33215 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nedd1P33215 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nedd1P33215 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd1P33215 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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