Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Saa4P31532 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Saa4P31532 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms