Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxc11P31313 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxc11P31313 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxc11P31313 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxc11P31313 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxc11P31313 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxc11P31313 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxc11P31313 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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