Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxc10P31257 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxc10P31257 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxc10P31257 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxc10P31257 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxc10P31257 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hoxc10P31257 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hoxc10P31257 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hoxc10P31257 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hoxc10P31257 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hoxc10P31257 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc10P31257 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Hoxc10P31257 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Hoxc10P31257 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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