Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VtnP29788 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VtnP29788 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VtnP29788 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VtnP29788 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VtnP29788 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VtnP29788 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VtnP29788 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VtnP29788 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VtnP29788 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VtnP29788 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
VtnP29788 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
VtnP29788 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
VtnP29788 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
VtnP29788 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
VtnP29788 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
VtnP29788 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms