Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pabpc1P29341 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pabpc1P29341 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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