Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprmP28828 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprmP28828 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PtprmP28828 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprmP28828 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms