Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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PdgfraP26618 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PdgfraP26618 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PdgfraP26618 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PdgfraP26618 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PdgfraP26618 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PdgfraP26618 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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PdgfraP26618 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PdgfraP26618 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PdgfraP26618 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PdgfraP26618 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PdgfraP26618 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PdgfraP26618 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PdgfraP26618 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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PdgfraP26618 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PdgfraP26618 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PdgfraP26618 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms