Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ChgaP26339 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms