Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gria1P23818 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gria1P23818 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gria1P23818 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gria1P23818 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gria1P23818 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms