Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pde6bP23440 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pde6bP23440 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6bP23440 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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