Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms