Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms