Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnnc1P19123 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms