Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sdc1P18828 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sdc1P18828 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms