Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18525 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
P18525 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
P18525 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18525 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18525 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18525 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18525 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18525 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms