Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim30aP15533 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms