Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RhoP15409 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RhoP15409 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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