Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb2P13373 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms