Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prf1P10820 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prf1P10820 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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