Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxd4P10628 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms