Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccl2P10148 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms