Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb7P09024 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms