Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04214 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
P04214 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04214 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04214 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04214 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04214 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04214 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04214 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04214 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04214 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04214 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P04214 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P04214 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P04214 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms