Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ldb2O55203 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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