Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Copb2O55029 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms